Quando criamos um relacionamento ou um modulo customizado no SugarCRM e algum problema ocorre no momento de eliminar o mesmo pelo modulo tradicional ( Buider ) temos a opção de remover manualmente todos os arquivos.
caso isso não seja feita da maneira adequada pode receber warnings na aplicação ou até não ter como acessa-lá.
Left Side Hand Relationship (module from which you created the relationship):
custom/Extension/modules/{moduleName}/Ext/Vardefs/{relationshipName}.php
custom/Extension/modules/{moduleName}/Ext/Layoutdefs/{relationshipName}.php
custom/Extension/modules/{moduleName}/Ext/Language/{relationshipName}.php
Right Side Hand Relationship:
custom/Extension/modules/{moduleName}/Ext/Vardefs/{relationshipName}.php
custom/Extension/modules/{moduleName}/Ext/Language/{relationshipName}.php
Relationship itself:
custom/metadata/{relationshipName}Meta.php
Table Dictionary:
custom/Extension/application/Ext/TableDictionary/{relationshipName}.php
Edit custom/application/Ext/TableDictionary/tabledictionary.ext.php file and delete include(‘custom/metadata/{relationshipName}.php’);
Para remover o relacionamento ,você deve deletar os arquivos .e depois remover fazendo a reparação no SugarCRM Admin -> Repair -> Quick Repair and Rebuild
Veja o artigos que me ajudou come ste problema:
http://redinkdesign.co/blarg/remove-sugarcrm-custom-relationship/